Průmyslová dekofeinizace byla poprvé úspěšně provedena v roce 1905 německou společností Café HAG. V současnosti existují různé způsoby odstraňování kofeinu ze zelených kávových zrn. JURA zbavuje kávová zrna kofeinu metodou bez použití chemikálií, kterou na konci 70. let vyvinula společnost Swiss Water Decaffeinated Coffee Company.

Prvním krokem je máčení kávových zrn v horké vodě, dokud se kofein a další pevné částice neuvolní do vody. Zrna z této úvodní fáze procesu se dále nepoužívají.

Voda obsahující kofein a další pevné částice následně prochází aktivním uhlíkovým filtrem, který zachycuje molekuly kofeinu. Do vody zbavené kofeinu se potom přidávají nová kávová zrna. Jelikož voda již obsahuje rozpuštěné pevné částice kávy, uvolňuje se tentokrát pouze kofein, zatímco ostatní chuťové složky zůstávají v kávových zrnech. Proces se opakuje, dokud není odstraněno 99,9 % kofeinu, protože káva bez kofeinu nesmí obsahovat více než 0,1 % této složky.

Kávová zrna se následně suší, čímž se zachovává většina jejich chuti a aroma. Jednou z nevýhod tohoto procesu jsou relativně vysoké náklady, neboť kofein vázaný na aktivní uhlík nelze dále využívat a samostatně prodávat. Dnes je na světě jen několik továren, které používají švýcarský vodní proces.